Journée de Travail

(Thème C , avec forte connotation inter-thèmes, notamment thème A et thème B)

Thème : « Partage de modèles d’objets anatomiques et physiologiques

pour la simulation d’images médicales cliniques »

Lieu : Paris, Maison de la recherche, 28 Rue Serpente 75006 Paris

Organisateurs : Irène Buvat, Tristan Glatard, Denis Friboulet

Date : Mardi 25 janvier 2011

Contexte :

L’utilisation de la simulation d’images médicales cliniques se répand, par exemple pour la phase initiale de la validation des performances des outils de traitement d’images ou pour le prototypage de systèmes d'imagerie. Les simulateurs utilisent en entrée un « modèle » de l’objet étudié, par exemple un modèle d’un organe ou d’une partie du corps. Ce modèle est par exemple représenté par une carte 3D de voxels ou par des maillages, qui matérialisent les éléments anatomiques et physiologiques mis en jeu, ainsi que, le cas échéant des éléments de pathologie voire des agents externes.

Partager des modèles d’objets anatomiques et physiologiques facilite le travail des chercheurs qui recourent à la simulation en leur permettant de partir de modèles existants pour les adapter aux besoins de leurs simulations. Idéalement, les modèles d'objets devraient pouvoir être réutilisés dans plusieurs types de simulation d'imagerie indépendamment de la modalité. Ceci pose la question de la séparation des informations à caractère anatomique / physiologique / pathologique de celles reliées aux caractéristiques et aux phénomènes physiques mis en jeu dans les équipements d’imagerie.

La question du partage des modèles pose naturellement la question de la description de leur contenu, avec un volet numérique (par exemple cartes 3D de voxels) et un volet symbolique (référence à des ontologies) explicitant les régions et structures anatomiques représentées, leurs caractéristiques physiques, l’utilisation d’agent de contraste, la présence de pathologies etc.

Objectif de la journée

Le but de la journée est d’apporter des éléments de réponse au partage de modèles pour la simulation d'images médicales en rassemblant des points de vue complémentaires sur la question, notamment : (1) utilisateurs de tels simulateurs d’images, (2) concepteurs de tels simulateurs et spécialistes de chaque modalité, (3) spécialistes de la représentation des connaissances anatomiques et (4) de la représentation de connaissances physiologiques ou physiques sur les tissus et organes étudiés.

Programme

Session 1 : outils et formats pour le partage de modèles

• 9h - 9h30 : Richard CHRISTIE, Auckland University, par vidéoconférence : "Field abstraction in FieldML and Cmgui" Présentation R Christie
• 9h30 - 10h00 : Bernard GIBAUD, IRISA, "Ontologies pour le partage de modèles" Présentation B Gibaud
• 10h00 - 10h30 : Adrien MARION, CREATIS, "IAMF : un format pour le partage de modèles dans la plate-forme VIP" Présentation A Marion

Session 2 : exemples d'utilisations de modèles en imagerie simulée

• 10h30 - 11h00 : Irène BUVAT, IMNC, "Modèles utilisés en simulation TEP et TEMP avec GATE" Présentation I Buvat
• 11h00 - 11h30 : Hugues BENOIT-CATTIN, CREATIS, "Partage de modèles pour la simulation IRM" Présentation H Benoit Cattin

11h30 - 13h30 : repas (libre)

Session 3 : conception et paramétrisation des modèles

• 13h30 - 14h : Ralf SINKUS, Laboratoire Ondes et Acoustique, "Mesure de l’élasticité et de la viscosité des tissus en IRM et US"
• 14h - 14h30 : David SARRUT, CREATIS, "Modélisation spatio-temporelle de la respiration à partir d'images tomodensitométriques thoracique" Présentation D Sarrut
• 14h30 - 14h50 : Juan Pablo DE LA PLATA ALCALDE, Télécom Paris, "Modélisation réaliste du corps humain à partir d'images médicales 3D et application en dosimétrie numérique" Présentation J Pablo de la Plata

14h50 - 15h30: Discussion générale