The Graduate School for Computing in Medicine and Life Sciences was
established in 2007 within the framework of the Excellence Initiative of
the German federal and state governments. It aims to integrate medicine,
computer science and life sciences through structured international
doctoral education rooted in a strong research foundation. The working
language at the Graduate School is English.

Several doctoral positions are still available. For further information,
please visit our website and submit your application online by June 30.

http://www.gradschool.uni-luebeck.de/

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Lübeck Excellence
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Lübeck is well known for its strength in medicine and computer science,
which is confirmed in the CHE university ranking
http://www.zeit.de/studium/ranking . In both 2006 and 2009, the University
of Lübeck remains No. 1 in medicine among all universities in Germany,
Austria and Switzerland. In Computer Science and Molecular Life Science,
the University was ranked No. 2 in the 2009 evaluation.

Lübeck is also a growing research university. A prime indicator of the
research achievements is the fact that Lübeck has won several times the
innovation prize for medical technology funded by the BMBF (German
Ministry of Education and Research), with the last one in 2008.


Living in Lübeck
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Lübeck is the UNESCO world culture heritage town. With two universities
and a music school in the area, the social life of the Hanseatic city is
highly student-oriented.

Surrounded by rivers and canals, greens and forests, and historical
buildings, Lübeck is a fascinating cultural town. Shops, cafés,
international restaurants, museums, theatres, and concert halls are found
in adjacent to each other in the city centre. Moreover, the fine and sandy
beach on the Baltic Sea adds to the charm of the unique town.

As an interesting and friendly town in north Germany, Lübeck is a great
place to study, work and enjoy life.



--
Yan Bailly, PhD

Managing Director
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Graduate School for Computing in Medicine and Life Sciences
-
Universität zu Lübeck
Ratzeburger Allee 160
D-23538 Lübeck, Germany
-
tel: +49 451 500 5670
fax: +49 451 500 5202
email: bailly@gradschool.uni-luebeck.de
web: http://www.gradschool.uni-luebeck.de
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Pré-traitement des signaux EEG de surface: application à l’imagerie de source électrique cérébrale des processus attentionnels et mnésiques

L'objectif principal de cette thèse est de faciliter l’extraction des informations spécifiques aux potentiels évoqués à partir d’EEG de surface « single-trial » à faible RSB. Cette information dite spécifique est à la fois morphologique (forme, amplitude, temps de latence du PE) et topographique (répartition spatiale en surface et, si possible, localisation en profondeur de la source ou des sources génératrices). Afin d’extraire cette information, il est d’abord nécessaire de développer une méthodologie de prétraitement essentiellement dédiée à l’élimination des artefacts et du bruit, mais capable de préserver toutes les caractéristiques nécessaires à la caractérisation temporelle, fréquentielle et spatiale des PE.
Différentes approches ont été déjà proposées dans la littérature les dernières années, la plupart basées sur des techniques de type décomposition temps fréquence (ondelettes ou autres atomes temps-fréquence, Iyer 2007, Bénar 2007) ou décomposition spatiale de type séparation de sources ou analyse en composantes principales (Iyer 2007, Barbati 2006, Bénar 2007, Porcaro 2010), voire également la combinaison de certaines de ces techniques (Hu 2010). Les travaux proposés dans cette thèse suivent cette dernière direction : optimiser une combinaison de techniques de séparation de sources et décomposition en ondelettes pour analyser et débruiter les PE à faible SNR.

contacts: didier.wolf@ensem.inpl-nancy.fr
radu.ranta@ensem.inpl-nancy.fr

Sujet de thèse proposé dans le cadre de l'équipe Ingénierie pour la Santé du Centre de Recherche en Automatique de Nancy (CRAN UMR 7039):

Pré-traitement des signaux EEG de surface: application à l’imagerie de source électrique cérébrale des processus attentionnels et mnésiques

L'objectif principal de cette thèse est de faciliter l’extraction des informations spécifiques aux potentiels évoqués à partir d’EEG de surface « single-trial » à faible RSB. Cette information dite spécifique est à la fois morphologique (forme, amplitude, temps de latence du PE) et topographique (répartition spatiale en surface et, si possible, localisation en profondeur de la source ou des sources génératrices). Afin d’extraire cette information, il est d’abord nécessaire de développer une méthodologie de prétraitement essentiellement dédiée à l’élimination des artefacts et du bruit, mais capable de préserver toutes les caractéristiques nécessaires à la caractérisation temporelle, fréquentielle et spatiale des PE.
Différentes approches ont été déjà proposées dans la littérature les dernières années, la plupart basées sur des techniques de type décomposition temps fréquence (ondelettes ou autres atomes temps-fréquence, Iyer 2007, Bénar 2007) ou décomposition spatiale de type séparation de sources ou analyse en composantes principales (Iyer 2007, Barbati 2006, Bénar 2007, Porcaro 2010), voire également la combinaison de certaines de ces techniques (Hu 2010). Les travaux proposés dans cette thèse suivent cette dernière direction : optimiser une combinaison de techniques de séparation de sources et décomposition en ondelettes pour analyser et débruiter les PE à faible SNR.

une proposition de thèse avec financement ANR.

Philippe Pudlo
GR MCSIB LAMIH UMR CNRS 8530
Université de Valenciennes

Proposition de thèse Université de Lyon / DosiSOFT (convention CIFRE). Titre de la thèse : Développement d'un code hybride Monte Carlo / déterministe pour le calcul de la dose biologique en hadronthérapie.

L'équipe I&M du LSIS recherche un ingénieur d'étude (CDD) en imagerie médicale pour contribuer au développement d'une plateforme logicielle pour la modélisation du comportement des organes pelviens.

http://www.lsis.org/caradype

Ce projet pluridisciplinaire est supporté par l'ANR.

 

Contact : marc-emmanuel.bellemare@lsis.org

· Profil enseignement:
Le candidat recruté interviendra dans les enseignements de traitement du signal, informatique industrielle et réseaux, pour les
étudiants des 4 semestres du Diplôme Universitaire de Technologie Génie Electrique et Informatique Industrielle (Geii) ainsi
que dans les autres diplômes portés par l'IUT. Il enseignera notamment les outils mathématiques pour le génie électrique. Les
enseignements auront lieu en cours magistraux, travaux dirigés et travaux pratiques aussi bien en formation initiale qu'en
formation par alternance.
Il est à noter qu'un esprit créatif dans le domaine pédagogique sera le bienvenu (création de nouveaux TP, approche attractive
des notions,…) du fait du public qu'accueille le département (50 % bac STI) et du caractère professionnalisant de la formation
au DUT. Une formation initiale EEA et des compétences en réseaux et télécommunications seront des atouts indéniables pour
le candidat lui permettant de s’adapter facilement aux enseignements dispensés dans le département et aux évolutions futures.
L’enseignent chercheur recruté sera amené à prendre des responsabilités administratives au sein du département GEii, telle que
la direction du Département ou la direction des études, ainsi qu'au sein de l'IUT. Il pourra être un élément moteur dans la
réorientation d'une partie du département vers des aspects réseaux et télécommunication.
Contact enseignement
Edmond GHRENASSIA, chef du département GEii IUT Lyon 1, Tel: 04 72 65 54 00
edmond.ghrenassia@univ-lyon1.fr http://geii.univ-lyon1.fr/
· Recherche
Le (La) candidat(e) recruté(e) mènera ses travaux de recherche dans l’unité CREATIS, spécialisée en imagerie bio-médicale,
(Université Lyon 1, CNRS UMR 5220, Inserm U630, INSA-Lyon) et localisée à Villeurbanne. CREATIS souhaite renforcer
ses équipes de recherche en modélisation et traitement de l'image. Le (La) candidat(e) proposera un projet d’intégration soit en
imagerie cardio-vasculaire ou pulmonaire, soit en imagerie cérébrale, soit en imagerie biologique (sujet émergent). Le (La)
candidat(e) recruté(e) aura des compétences scientifiques reconnues attestées par des publications internationales de haut
niveau.
Compétences : Modélisation et traitement de l’image.
· Laboratoire d'accueil :
CREATIS, CNRS UMR5220, Inserm U630
Contacts :
Correspondant Profil Recherche :
Remy Prost, remy.prost@creatis.insa-lyon.fr;
Isabelle Magnin, isabelle.magnin@creatis.insa-lyon.fr (directeur)
Christian Cachard, christian.cachard@univ-lyon1.fr

"Modélisation, détection et contrôle de la chute d'une personne handicapée"

­ Financement : Allocation de recherche fléchée 2009,
IBISC FRE 3190 CNRS , équipe HANDS 0 Rue du Pelvoux,
91020 Evry cedex
courriel du contact scientifique : gilbert.pradel@ens­-cachan.fr

Echosens,une start-up spécialisée dans le diagnostic médical innovant à destination des hépatologue souhaite recruter un stagiaire de niveau ingénieur/M2 pour un stage de fin d'étude en physique/instrumentation pour une durée de 6 mois.

La société est située dans le 13ème arrodissement de Paris.

Pour de plus amples informations merci de contacter Magali Sasso (magali.sasso@echosens.com).

Proposition d'un sujet de thèse:

'Développement d’un Outil Clinique de Modulographie Morphométrique pour l’Aide à la Prédiction de Rupture de la Plaque d’Athérome Vulnérable Carotidienne'

financée par une ADR de la Région Rhône-Alpes (Cluster ISLE Informatique, Signal et Logiciel Embarqué). Co-encadrement TIMC-Grenoble/CREATIS-Lyon. Début: Octobre 2010.

Contacts:  Jacques Ohayon, Jacques.Ohayon@imag.fr

Patrick Clarysse, patrick.clarysse@creatis.insa-lyon.fr

 

 

La version définitive du programme des XXIIes Entretiens Annuels de la Fondation Garches.

De la part de:

Guislaine Jacquemart
Pour Georges André
Vocatif, Conseil de la Fondation Garches
18, rue Juge / 75015 Paris
Tél: 01 43 55 33 60
Fax: 01 43 55 38 31

Poste MCF 61/63

 

UPEC (Université Paris Est Créteil)

 

Faculté des Sciences et Technologie

 

Profil enseignement :

Réseaux informatiques (M2) et réseaux locaux industriels (M1),  Programmation objet (M1), Informatique industrielle (M1/M2),

 

Profil  recherche:

Le candidat s’intégrera au LISSI (Laboratoire Images, Signaux et Systèmes Intelligents) dans une équipe spécialisée en Traitement du Signal et de l’Image appliqué au domaine médical (bio-métrie, modèles bio-inspirés, imagerie, compression, aide au diagnostic). Il sera apprécié que le candidat, spécialiste en Traitement du Signal et de l’Image, ait une expérience en analyse d’images 3D voire 3D +t. Le candidat participera à l’élaboration de projets scientifiques et s’impliquera dans les actions des pôles de compétitivité d’Ile de France.

 

Contact : Eric PETIT           eric.petit@u-pec.fr

 

Date limite de candidature : 25 Mars 2010

Postdoctoral position, Ecole des Mines, Saint-Etienne, France.

12 to 18 months.

title: 3D scanning wide field non-contact specular microscope

 

apply by sending an email to: gavet@emse.fr with resume.

Post doc position available at the Imaging and Modelling in Neurobiology and Cancerology lab in Orsay, in the framework of the FP7 ENVISION project

Monte Carlo simulations for in-beam emission tomograph

Key-words: hadrontherapy, in-beam emisison tomography, Monte Carlo simulations, GATE, Geant4

A Virtual Imaging Platform for the Virtual Physiological Human

The Virtual Imaging Platform (VIP) is a French project aiming at integrating medical image simulators from the 4 main modalities (MR, US, CT and PET) in a web platform offering computing power and semantic facilities to share and reuse organ models, simulated data and simulation tools. In VIP processes involved in simulations are described as workflows to facilitate (i) semantic data annotation and (ii) deployment on computing infrastructures. During the first phase of the VIP project, core simulation workflows were developed using the MOTEUR software and they now run on the European Grid Infrastructure.

The task of this post-doc project is to make VIP workflows available to the VPH (Virtual Physiological Human)community by developing a tool to import MOTEUR workflows in the VPH ToolKit. In particular, the resulting solution will enable an end-to-end execution of MOTEUR workflows on the DEISA computing platform through the VPH ToolKit.

More details about this post-doc may be found at : http://www.creatis.insa-lyon.fr/site/en/node/42986

SEE : http://www.creatis.insa-lyon.fr/site/en/node/43163

 

See : http://www.creatis.insa-lyon.fr/site/en/node/43162